Diseño con Balsamiq Mockups

Tengo un proyecto en mente (o en papel, en correo, o donde sea que lo tenga), para mí resulta muy conveniente empezar a rayonear sobre un papel las ideas de por donde atacar el proyecto, poco a poco va tomando forma y eventualmente llego a pequeñas conclusiones, que quiero conservar para futuras referencias.

En este punto estoy ante varios problemas:

• De todas las hojas con diagramas, dibujos, notas y recordatorios, necesito extraer solo lo que es parte de dichas conclusiones, y rehacerlo me da gueva, gueva de la buena, así que algunas veces encierro en un círculo lo que necesito y lo conservo todo.
• Lo que con el tiempo me lleva a otro problema, cuando trato de entender todo el rayoneo, definitivamente me niego a tratar de entenderlo.
• No habrá algún software que me ayude con esto?

Sip, en un libro encontré como referencia los "Mocos" de Balsamiq, una maravilla para mi.

• La página principal:  http://www.balsamiq.com/ y http://www.balsamiq.com/company
  
• Ejemplos: http://www.balsamiq.com/products/mockups/examples
• Demo en YouTube: http://www.youtube.com/watch?v=zLysy3IPfFI
• Demo en QuickTime video de alta resolución: http://www.balsamiq.com/videos/intro.mov
  

Yo no tengo nada que ver con ellos, ni gano absolutamente nada. Chequénla y vean si les funciona.
Para mi resuelve una parte del Diseño de Software.